34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3757 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  100 
 
 		 295 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  57.4 
 
 		 265 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  56.18 
 
 		 269 aa  291  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  50.87 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  53.31 
 
 		 282 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  52.45 
 
 		 282 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  52.94 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  53.57 
 
 		 290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  52.86 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  51.03 
 
 		 277 aa  277  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  52.67 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  52.86 
 
 		 287 aa  276  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  51.25 
 
 		 281 aa  275  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  48.94 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  49.47 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  44.72 
 
 		 282 aa  228  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  32.99 
 
 		 280 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  34.8 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  31.6 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  29.35 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  31.01 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  27.76 
 
 		 237 aa  92.8  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  26.79 
 
 		 253 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  26.86 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  43.01 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  31.96 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  36.05 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  28.91 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  25.87 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  24.66 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1145 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1104 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  32.76 
 
 		 567 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2703  hypothetical protein  28.75 
 
 		 167 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.345909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>