36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3741 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  54.68 
 
 		 282 aa  291  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  54.06 
 
 		 287 aa  289  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  54.06 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  55.72 
 
 		 282 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  55.35 
 
 		 282 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  55.72 
 
 		 282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  53.71 
 
 		 287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  53.21 
 
 		 290 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  53.85 
 
 		 281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  49.47 
 
 		 295 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  51.69 
 
 		 265 aa  269  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  52.69 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  49.27 
 
 		 269 aa  256  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  47.45 
 
 		 277 aa  254  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  47.2 
 
 		 282 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  33.56 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  34.27 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  31.54 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  29.2 
 
 		 237 aa  96.3  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  28.93 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  28.01 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  28.99 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  28.26 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  37.19 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  29.54 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  25.87 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  28.67 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  28 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  23.62 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  35 
 
 		 1145 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  24.91 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  33.33 
 
 		 567 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  39.06 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2703  hypothetical protein  28.18 
 
 		 167 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.345909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1160  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.43 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>