41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0394 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  100 
 
 		 268 aa  540  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  52.81 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  48.08 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  45.68 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  36.3 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  39.32 
 
 		 297 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  28.62 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  28.57 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  25.53 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  28.07 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  28.42 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  28.47 
 
 		 282 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  29.05 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  28.88 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  28.81 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  27.76 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  29.15 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  28.17 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  27.87 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  27.46 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  25.47 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  26.88 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  27.7 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  26.89 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  26.12 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  29.54 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  26.92 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  26.45 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  30.33 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  24.9 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1145 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  30.86 
 
 		 170 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  33.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  34.57 
 
 		 160 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  29.56 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  28.93 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  32.76 
 
 		 193 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  30.85 
 
 		 169 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1104 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  50 
 
 		 146 aa  42  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  28.8 
 
 		 144 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>