22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1034 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  100 
 
 		 1104 aa  2231    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  64.97 
 
 		 1145 aa  1482    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1292 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  55.88 
 
 		 603 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  44.3 
 
 		 610 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  45.12 
 
 		 1544 aa  65.1  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.08 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  40 
 
 		 631 aa  65.1  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  52.73 
 
 		 608 aa  64.3  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  45.59 
 
 		 1626 aa  63.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.23 
 
 		 648 aa  60.1  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4247  hypothetical protein  39.19 
 
 		 137 aa  51.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.78 
 
 		 680 aa  50.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2528  hypothetical protein  39.73 
 
 		 321 aa  49.7  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000345829  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1027  hypothetical protein  27.13 
 
 		 212 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  34.48 
 
 		 277 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  35 
 
 		 282 aa  47  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  25.84 
 
 		 269 aa  46.2  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  45.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  29.82 
 
 		 265 aa  45.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  42.86 
 
 		 287 aa  45.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  31.58 
 
 		 287 aa  44.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>