42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3651 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  100 
 
 		 287 aa  585  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  96.17 
 
 		 287 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  94.43 
 
 		 287 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  81.6 
 
 		 282 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  76.74 
 
 		 282 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  76.74 
 
 		 282 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  76.74 
 
 		 282 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  77.9 
 
 		 281 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  76.68 
 
 		 290 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  61.29 
 
 		 278 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  52.86 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  52.63 
 
 		 277 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  51.8 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  55.07 
 
 		 275 aa  262  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  49.13 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  47.2 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  36.79 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  35.67 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  30.14 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  30.34 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  29.33 
 
 		 261 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  27.44 
 
 		 253 aa  92.8  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  28.62 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  28.83 
 
 		 251 aa  89.4  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  28.04 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  30.38 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  27.96 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  44.09 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  27.46 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  36.56 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1145 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  33.33 
 
 		 567 aa  45.8  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1160  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  25.24 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0973  hypothetical protein  31.67 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1104 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2703  hypothetical protein  28.77 
 
 		 167 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.345909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1728  hypothetical protein  30.38 
 
 		 160 aa  42.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.148636  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  37.14 
 
 		 344 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  33.67 
 
 		 201 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1511  hypothetical protein  31.11 
 
 		 198 aa  42.4  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000444179  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  35.38 
 
 		 343 aa  42.4  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>