39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0476 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  100 
 
 		 287 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  98.26 
 
 		 287 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  94.43 
 
 		 287 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  81.6 
 
 		 282 aa  472  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  77.43 
 
 		 282 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  77.78 
 
 		 282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  77.78 
 
 		 282 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  79.27 
 
 		 281 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  77.74 
 
 		 290 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  61.29 
 
 		 278 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  52.67 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  52.52 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  52.08 
 
 		 277 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  53.71 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  48.44 
 
 		 269 aa  256  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  47.33 
 
 		 282 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  34.14 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  36.21 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  31.62 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  30.04 
 
 		 261 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  28.72 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  30.82 
 
 		 287 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  27.64 
 
 		 237 aa  89.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  28.28 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  27.76 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  31.38 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  27.14 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  29.15 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  27.95 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  35.09 
 
 		 1145 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1160  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.67 
 
 		 207 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  33.33 
 
 		 567 aa  45.8  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1104 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  26.57 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1728  hypothetical protein  30.38 
 
 		 160 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.148636  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0973  hypothetical protein  30.83 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2703  hypothetical protein  27.4 
 
 		 167 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.345909 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  35.38 
 
 		 343 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>