16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0973 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0973  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  305  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2703  hypothetical protein  27.89 
 
 
167 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.345909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1547  hypothetical protein  30.52 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1027  hypothetical protein  29.02 
 
 
212 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2112  putative general secretion pathway protein J  36.71 
 
 
237 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0110516  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1160  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  22.73 
 
 
207 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1600  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  39.68 
 
 
245 aa  48.5  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0961  hypothetical protein  36.67 
 
 
550 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.209127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1720  hypothetical protein  28.97 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0996  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.899826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0266  hypothetical protein  36.07 
 
 
326 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343829  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  30.83 
 
 
287 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  30.83 
 
 
287 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  31.67 
 
 
287 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0915  putative general secretion pathway protein J  31.76 
 
 
254 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5158  hypothetical protein  29.66 
 
 
468 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380985  normal  0.477564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>