41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5158 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5158  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  886    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380985  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  43.12 
 
 
2313 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  57.29 
 
 
407 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  48.91 
 
 
489 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1600  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  39.56 
 
 
245 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  38.64 
 
 
268 aa  63.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3384  hypothetical protein  45.71 
 
 
437 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.356218  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  29.91 
 
 
484 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  31.58 
 
 
489 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  44.21 
 
 
830 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.73 
 
 
257 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  28.83 
 
 
444 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  26.99 
 
 
1888 aa  58.5  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  24.03 
 
 
2272 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  47.37 
 
 
1567 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  33.93 
 
 
778 aa  56.6  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  24.03 
 
 
2179 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.4 
 
 
261 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  40 
 
 
433 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  53.66 
 
 
687 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  32.61 
 
 
551 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  53.93 
 
 
952 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  52.27 
 
 
1000 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  50 
 
 
625 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0373  hypothetical protein  34.29 
 
 
228 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  28.16 
 
 
555 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  38.6 
 
 
1281 aa  50.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  45.54 
 
 
1461 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  41.94 
 
 
522 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  41.86 
 
 
479 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  44.12 
 
 
584 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47575  predicted protein  36.21 
 
 
744 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4840  hypothetical protein  33.33 
 
 
908 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191443  hitchhiker  0.00180703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  37.88 
 
 
667 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  32.03 
 
 
581 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  25 
 
 
928 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  29.68 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  34.78 
 
 
467 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.7 
 
 
1162 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  30.77 
 
 
488 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  37.78 
 
 
572 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>