More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1550 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
1162 aa  2225    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.62 
 
 
396 aa  308  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  56.27 
 
 
389 aa  306  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  51.68 
 
 
328 aa  293  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  51.69 
 
 
343 aa  279  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  49.85 
 
 
363 aa  279  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.91 
 
 
367 aa  273  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  50.41 
 
 
857 aa  270  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  50.3 
 
 
347 aa  267  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1275  histidine kinase  51.37 
 
 
395 aa  258  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.207419 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  48.47 
 
 
360 aa  251  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09570  signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 
382 aa  245  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
357 aa  224  6e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  37.16 
 
 
391 aa  214  9e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
639 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
639 aa  190  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  36.12 
 
 
508 aa  190  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
639 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
467 aa  189  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
470 aa  188  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
471 aa  188  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  36.36 
 
 
463 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
473 aa  186  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3567  hypothetical protein  38.2 
 
 
474 aa  184  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  38.71 
 
 
473 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  34.92 
 
 
463 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  38.41 
 
 
518 aa  182  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
493 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  34.92 
 
 
463 aa  182  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  34.92 
 
 
463 aa  182  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  35.22 
 
 
456 aa  181  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
468 aa  181  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
473 aa  180  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0432  signal transduction histidine kinase-like protein  40.95 
 
 
434 aa  179  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.986525  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
487 aa  179  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
471 aa  178  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  39.26 
 
 
496 aa  178  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
385 aa  178  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  35.03 
 
 
461 aa  178  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  36.55 
 
 
466 aa  178  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  36.55 
 
 
466 aa  178  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
389 aa  177  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 
365 aa  176  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  37.09 
 
 
470 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  36.3 
 
 
468 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  34.35 
 
 
462 aa  176  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  34.58 
 
 
463 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  38.77 
 
 
480 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
462 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
466 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
459 aa  175  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
379 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  33.88 
 
 
463 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  36.4 
 
 
466 aa  173  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
518 aa  174  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  37.42 
 
 
518 aa  174  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
379 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
425 aa  174  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
379 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  34.71 
 
 
466 aa  173  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  36.03 
 
 
466 aa  172  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  36.03 
 
 
466 aa  172  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  36.03 
 
 
466 aa  172  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  36.03 
 
 
466 aa  172  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
458 aa  172  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  36.03 
 
 
466 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  36.4 
 
 
466 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  34.49 
 
 
463 aa  172  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
389 aa  172  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  34.01 
 
 
463 aa  172  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
457 aa  172  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  33.44 
 
 
463 aa  171  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
496 aa  171  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
640 aa  170  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.29 
 
 
455 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
504 aa  169  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  34.64 
 
 
455 aa  168  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  34.64 
 
 
455 aa  168  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
641 aa  167  8e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.95 
 
 
461 aa  167  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  32.29 
 
 
467 aa  167  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  38.61 
 
 
482 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 
589 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  32.17 
 
 
482 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  36.69 
 
 
501 aa  167  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
367 aa  166  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
364 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.68 
 
 
467 aa  166  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
382 aa  166  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.83 
 
 
457 aa  166  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  44.4 
 
 
537 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
358 aa  165  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.6 
 
 
461 aa  165  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.6 
 
 
461 aa  165  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  28.35 
 
 
458 aa  165  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  36.49 
 
 
356 aa  165  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 
597 aa  165  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  35.38 
 
 
391 aa  164  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
375 aa  164  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
597 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>