More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0594 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 391 aa  802    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  72.59 
 
 		 357 aa  504  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  41.33 
 
 		 363 aa  269  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  44.03 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09570  signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  45.06 
 
 		 347 aa  252  8.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  38.97 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1275  histidine kinase  40.06 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.207419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 367 aa  236  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  38.15 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  40.77 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  44.98 
 
 		 857 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.16 
 
 		 1162 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  33 
 
 		 463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  31.72 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 458 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.33 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.48 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 639 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 379 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 639 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.54 
 
 		 461 aa  152  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.54 
 
 		 461 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.54 
 
 		 461 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  31.36 
 
 		 423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 639 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.67 
 
 		 452 aa  147  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  31.72 
 
 		 364 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  31.72 
 
 		 364 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 518 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 482 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  31.21 
 
 		 518 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  26.62 
 
 		 603 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 496 aa  145  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.62 
 
 		 457 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  33.95 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 493 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 364 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  26.28 
 
 		 603 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 641 aa  143  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  31.77 
 
 		 473 aa  142  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  29.49 
 
 		 518 aa  142  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  26.28 
 
 		 603 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  26.28 
 
 		 603 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  26.28 
 
 		 603 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.04 
 
 		 461 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  26.28 
 
 		 603 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  26.28 
 
 		 603 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  26.96 
 
 		 604 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  28.19 
 
 		 467 aa  142  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.07 
 
 		 455 aa  142  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 432 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000747291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  30.87 
 
 		 458 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  30.45 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  29.93 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  30.45 
 
 		 466 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 723 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  29.77 
 
 		 458 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 463 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 601 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  30.43 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 483 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  26.21 
 
 		 473 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 466 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  31.93 
 
 		 468 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 466 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 466 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 829 aa  140  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2023  histidine kinase  31.89 
 
 		 473 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.618926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>