More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6209 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  100 
 
 		 343 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.36 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  53.64 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  55.49 
 
 		 857 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  51.94 
 
 		 389 aa  295  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.59 
 
 		 367 aa  293  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  50.74 
 
 		 347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  51.76 
 
 		 360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  51.69 
 
 		 1162 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  51.56 
 
 		 363 aa  276  5e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09570  signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 		 382 aa  269  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1275  histidine kinase  49.56 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.207419 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  41.37 
 
 		 391 aa  229  4e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 357 aa  225  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  35.69 
 
 		 496 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 473 aa  172  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.82 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 467 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.46 
 
 		 461 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.46 
 
 		 461 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  30.79 
 
 		 508 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  32.18 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 389 aa  162  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 471 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  33.72 
 
 		 473 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32.97 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 470 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  32.18 
 
 		 466 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  32.18 
 
 		 466 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  35.4 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  32.18 
 
 		 466 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  32.18 
 
 		 466 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 471 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 493 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 451 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  31.86 
 
 		 466 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  32.13 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  33.97 
 
 		 466 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  31.86 
 
 		 466 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 451 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 458 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 640 aa  158  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 473 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.98 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.1 
 
 		 467 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 483 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.41 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 367 aa  155  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.1 
 
 		 453 aa  155  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.1 
 
 		 457 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  27.6 
 
 		 603 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  33.07 
 
 		 466 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 604 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  32.88 
 
 		 468 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  27.6 
 
 		 603 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.9 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 493 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 468 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 723 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 518 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  33.97 
 
 		 518 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.53 
 
 		 467 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.9 
 
 		 467 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 425 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.53 
 
 		 467 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  32.63 
 
 		 463 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1517  sensor histidine kinase  27.6 
 
 		 604 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 504 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  26.95 
 
 		 603 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  26.95 
 
 		 603 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  26.95 
 
 		 603 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  26.95 
 
 		 603 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  26.95 
 
 		 603 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 483 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 639 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  35.53 
 
 		 467 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  35.53 
 
 		 467 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  35.53 
 
 		 467 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.53 
 
 		 467 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  35.96 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.53 
 
 		 467 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 487 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 552 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  25.43 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 453 aa  149  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 458 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  26.95 
 
 		 603 aa  149  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  36.21 
 
 		 465 aa  149  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 359 aa  149  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 383 aa  149  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  34.62 
 
 		 472 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>