More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4671 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 723 aa  1399    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  62.13 
 
 		 593 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  47.16 
 
 		 592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  49.71 
 
 		 594 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.18 
 
 		 471 aa  229  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 425 aa  226  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 471 aa  226  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  45.49 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  44.72 
 
 		 558 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  38.68 
 
 		 463 aa  218  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  43.06 
 
 		 364 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  43.06 
 
 		 364 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 473 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 		 483 aa  214  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 		 389 aa  213  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  40.71 
 
 		 470 aa  213  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  40.58 
 
 		 473 aa  212  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 389 aa  212  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 613 aa  211  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  44.1 
 
 		 463 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 465 aa  208  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  42.5 
 
 		 449 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 		 359 aa  204  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 358 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 382 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 364 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 		 370 aa  201  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 383 aa  201  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 310 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  31.29 
 
 		 473 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 493 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 379 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  36.86 
 
 		 501 aa  196  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  32.62 
 
 		 482 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 458 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  39.07 
 
 		 354 aa  194  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 371 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 487 aa  194  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 379 aa  194  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  45.26 
 
 		 369 aa  194  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  41.89 
 
 		 482 aa  193  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  38.93 
 
 		 391 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  43.4 
 
 		 472 aa  192  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  34.56 
 
 		 508 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 459 aa  192  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 463 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  36.73 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.18 
 
 		 467 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 		 483 aa  190  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  40.81 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.32 
 
 		 369 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  39.86 
 
 		 356 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  40.21 
 
 		 518 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 		 518 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2307  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 666 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 468 aa  188  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 		 507 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  40.81 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  40.81 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  40.81 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  40.81 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  40.81 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  39.8 
 
 		 512 aa  187  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  39.06 
 
 		 477 aa  187  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  40.44 
 
 		 467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  42.42 
 
 		 469 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  41.64 
 
 		 516 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  33.66 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.81 
 
 		 453 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  40.44 
 
 		 467 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 385 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 639 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 		 470 aa  185  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  38.1 
 
 		 480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 639 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 395 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  40.21 
 
 		 360 aa  184  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 639 aa  184  6e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  36.69 
 
 		 465 aa  184  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  33.9 
 
 		 466 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 394 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  33.9 
 
 		 466 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  33.9 
 
 		 466 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  33.9 
 
 		 466 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  33.9 
 
 		 466 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  30.61 
 
 		 514 aa  183  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  40.66 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>