More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1713 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  100 
 
 
464 aa  956    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.27 
 
 
463 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
464 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
451 aa  333  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
451 aa  331  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  37.56 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  43.14 
 
 
310 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
496 aa  249  7e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.63 
 
 
463 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
383 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
359 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  41.37 
 
 
356 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  30.95 
 
 
518 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  39.71 
 
 
391 aa  225  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
382 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
358 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
500 aa  220  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
483 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  39.02 
 
 
354 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
483 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  31.36 
 
 
501 aa  213  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
425 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
518 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  32.09 
 
 
518 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
458 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
379 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
379 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1103  histidine kinase  38.04 
 
 
360 aa  207  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
394 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
394 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
379 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.23 
 
 
457 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.91 
 
 
461 aa  203  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
463 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.08 
 
 
455 aa  203  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.34 
 
 
512 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  35.81 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.9 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.69 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.69 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
473 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  36.59 
 
 
369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 
380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  35.05 
 
 
482 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.11 
 
 
460 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  29.92 
 
 
473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  27.53 
 
 
449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  36.79 
 
 
508 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
473 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
394 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.92 
 
 
453 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32.8 
 
 
470 aa  196  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
367 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
369 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  35.96 
 
 
465 aa  194  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
370 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  35 
 
 
423 aa  193  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.76 
 
 
467 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.54 
 
 
467 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
380 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
723 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.54 
 
 
467 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
389 aa  189  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
589 aa  189  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  28.54 
 
 
467 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  28.54 
 
 
467 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.54 
 
 
467 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.54 
 
 
467 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
394 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
493 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  34.03 
 
 
363 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
375 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  28.54 
 
 
467 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  36.69 
 
 
360 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
371 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  34.98 
 
 
357 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
354 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
395 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
463 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.33 
 
 
467 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  39.92 
 
 
613 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  36.01 
 
 
496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  34.36 
 
 
351 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
619 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.24 
 
 
467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
365 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2307  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
666 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.33 
 
 
467 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.11 
 
 
467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  35.53 
 
 
472 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2934  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0322426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  34.48 
 
 
357 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
389 aa  184  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.33 
 
 
467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  32.79 
 
 
516 aa  183  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>