More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2476 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  89.29 
 
 
467 aa  833    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  89.29 
 
 
467 aa  833    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  99.57 
 
 
467 aa  951    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  89.08 
 
 
467 aa  841    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  69.18 
 
 
460 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  100 
 
 
467 aa  954    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  83.69 
 
 
467 aa  775    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  99.79 
 
 
467 aa  953    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  89.29 
 
 
467 aa  834    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  99.57 
 
 
467 aa  952    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  99.79 
 
 
467 aa  951    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  89.29 
 
 
467 aa  833    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  89.29 
 
 
467 aa  833    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  89.08 
 
 
467 aa  831    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  89.51 
 
 
467 aa  834    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  89.29 
 
 
467 aa  833    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  67.25 
 
 
461 aa  627  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  67.25 
 
 
461 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  67.25 
 
 
461 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  66.67 
 
 
455 aa  615  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  65.71 
 
 
457 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  61.32 
 
 
452 aa  558  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  59.91 
 
 
453 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  46.41 
 
 
463 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 
518 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  42.69 
 
 
518 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  42.95 
 
 
482 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  41.88 
 
 
512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  42.89 
 
 
480 aa  353  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
507 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  43.48 
 
 
465 aa  339  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  45.26 
 
 
472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
493 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
463 aa  333  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  41.88 
 
 
516 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  35.15 
 
 
482 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
454 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  34.9 
 
 
471 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
488 aa  267  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
483 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  36.23 
 
 
499 aa  259  9e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
501 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  34.64 
 
 
455 aa  249  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  33 
 
 
495 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  32.59 
 
 
514 aa  246  9e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  33.07 
 
 
529 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
527 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
425 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  40.57 
 
 
423 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  40.36 
 
 
593 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
471 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  27.97 
 
 
463 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1774  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
483 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0978  histidine kinase  35.63 
 
 
495 aa  195  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947826  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  34.83 
 
 
469 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  31.11 
 
 
449 aa  193  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
359 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3144  histidine kinase  39.52 
 
 
549 aa  190  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
510 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  28.33 
 
 
464 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  34.46 
 
 
356 aa  187  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
483 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
358 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
408 aa  186  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  35.93 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  37.45 
 
 
473 aa  184  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  37.09 
 
 
470 aa  183  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  29.09 
 
 
466 aa  183  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  29.09 
 
 
466 aa  183  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  29.09 
 
 
466 aa  183  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  29.09 
 
 
466 aa  183  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  33.83 
 
 
466 aa  183  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
483 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
463 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
395 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  29.09 
 
 
466 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
395 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  32.94 
 
 
466 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
394 aa  181  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  28.63 
 
 
466 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  32.94 
 
 
466 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
500 aa  180  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
459 aa  179  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  28.63 
 
 
466 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
464 aa  179  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
465 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
451 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
379 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  36.67 
 
 
594 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  35.06 
 
 
496 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
379 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
375 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 
370 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
470 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  29.77 
 
 
518 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
385 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
379 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>