More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2589 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  100 
 
 
499 aa  1021    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
493 aa  316  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  36.78 
 
 
482 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  36 
 
 
480 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.87 
 
 
461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.25 
 
 
457 aa  309  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.47 
 
 
461 aa  309  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.47 
 
 
461 aa  309  9e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.05 
 
 
455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.97 
 
 
467 aa  299  9e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.77 
 
 
467 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.18 
 
 
467 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  37.57 
 
 
467 aa  296  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  37.57 
 
 
467 aa  296  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.57 
 
 
467 aa  296  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.57 
 
 
467 aa  296  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  37.57 
 
 
467 aa  296  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.77 
 
 
467 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.63 
 
 
460 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.98 
 
 
467 aa  295  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.77 
 
 
467 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.27 
 
 
453 aa  294  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.38 
 
 
467 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.57 
 
 
467 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.57 
 
 
467 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.57 
 
 
467 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.07 
 
 
452 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  35.02 
 
 
518 aa  287  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
518 aa  287  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.27 
 
 
465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
463 aa  276  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  34.27 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.27 
 
 
512 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  34.01 
 
 
514 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
468 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
501 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  30.86 
 
 
463 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
488 aa  266  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  39.4 
 
 
455 aa  259  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  30.5 
 
 
471 aa  259  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
483 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  32.74 
 
 
472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.23 
 
 
495 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
507 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
454 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  34.62 
 
 
529 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  35.33 
 
 
423 aa  217  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
527 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
425 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  37 
 
 
593 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
463 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  33.11 
 
 
463 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
723 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
471 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
471 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  35.1 
 
 
469 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
385 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  34.3 
 
 
473 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
375 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.57 
 
 
470 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
451 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1774  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
483 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
458 aa  177  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
395 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
451 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0978  histidine kinase  29.62 
 
 
495 aa  176  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
394 aa  176  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  31.4 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  28.74 
 
 
464 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
473 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
359 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00300746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
510 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  36.17 
 
 
391 aa  174  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  34.69 
 
 
594 aa  174  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  33.55 
 
 
310 aa  174  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 
464 aa  174  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
382 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
483 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  33.55 
 
 
473 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
437 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
383 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  35.77 
 
 
558 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
379 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
379 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  29.09 
 
 
518 aa  170  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
379 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
473 aa  169  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
358 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  33.33 
 
 
354 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  31.32 
 
 
465 aa  169  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3144  histidine kinase  33.02 
 
 
549 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
364 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  29.65 
 
 
455 aa  166  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  29.65 
 
 
455 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
476 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>