More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1774 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1774  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 483 aa  947    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.37 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.61 
 
 		 460 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.16 
 
 		 457 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  34.44 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 493 aa  216  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.56 
 
 		 467 aa  213  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 482 aa  210  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.34 
 
 		 467 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.23 
 
 		 452 aa  209  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.33 
 
 		 465 aa  209  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.34 
 
 		 467 aa  209  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  34.34 
 
 		 467 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  34.34 
 
 		 467 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.34 
 
 		 467 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.09 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  34.34 
 
 		 467 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.34 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.34 
 
 		 467 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 518 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  33.46 
 
 		 518 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.8 
 
 		 461 aa  206  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.8 
 
 		 461 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.08 
 
 		 453 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.48 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.89 
 
 		 467 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.19 
 
 		 467 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.41 
 
 		 467 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.47 
 
 		 467 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.19 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 471 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.69 
 
 		 512 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  28.31 
 
 		 514 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 483 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  31.89 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  39.1 
 
 		 516 aa  192  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  35.03 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  36.17 
 
 		 472 aa  186  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 507 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 454 aa  181  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 488 aa  181  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  30.54 
 
 		 455 aa  177  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 379 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 394 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  33.46 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 473 aa  160  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  40.08 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  34.73 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.67 
 
 		 495 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  33.95 
 
 		 469 aa  156  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 473 aa  156  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 354 aa  155  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  36.03 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  35.04 
 
 		 529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 451 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  37.88 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 395 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 380 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  35.94 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  36.7 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 527 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 471 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  27.49 
 
 		 473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 389 aa  147  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 408 aa  147  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 458 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 510 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 458 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 332 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2605  ATP-binding region ATPase domain protein  31.65 
 
 		 410 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4232  ATP-binding region ATPase domain protein  31.65 
 
 		 410 aa  144  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  34.08 
 
 		 423 aa  143  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  34.32 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0978  histidine kinase  30.43 
 
 		 495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947826  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1791  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.813908  normal  0.38268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  32.98 
 
 		 391 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3144  histidine kinase  34.09 
 
 		 549 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>