More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0978 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0978  histidine kinase  100 
 
 
495 aa  972    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947826  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  98.18 
 
 
510 aa  949    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.57 
 
 
527 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  47.67 
 
 
529 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3144  histidine kinase  57.07 
 
 
549 aa  352  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  34.5 
 
 
463 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  34.74 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
463 aa  234  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.47 
 
 
461 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.07 
 
 
467 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.27 
 
 
461 aa  229  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.27 
 
 
461 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  36.22 
 
 
467 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  36.22 
 
 
467 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  36.22 
 
 
467 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.22 
 
 
467 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.22 
 
 
467 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.96 
 
 
467 aa  228  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.74 
 
 
455 aa  227  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.16 
 
 
467 aa  226  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.02 
 
 
467 aa  226  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  33.8 
 
 
471 aa  226  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  34.94 
 
 
480 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.51 
 
 
453 aa  223  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.76 
 
 
467 aa  223  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.47 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.56 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.56 
 
 
467 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  35.59 
 
 
516 aa  220  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.56 
 
 
467 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.56 
 
 
467 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.87 
 
 
467 aa  219  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.86 
 
 
460 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  37.13 
 
 
472 aa  217  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.4 
 
 
452 aa  216  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  30.33 
 
 
482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
493 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
518 aa  203  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  34.32 
 
 
518 aa  203  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
468 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
379 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
379 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  31.96 
 
 
482 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
379 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
385 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  30.39 
 
 
455 aa  189  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
425 aa  179  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
507 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  26.19 
 
 
464 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
394 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  38.23 
 
 
369 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
501 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
389 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.68 
 
 
512 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  27.13 
 
 
514 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
389 aa  171  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
394 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
394 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
395 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
379 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  35.84 
 
 
356 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
381 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
381 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  32.5 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
395 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  37.3 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
483 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  36.46 
 
 
499 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.71 
 
 
495 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  37.11 
 
 
363 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
332 aa  159  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2605  ATP-binding region ATPase domain protein  34.19 
 
 
410 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4232  ATP-binding region ATPase domain protein  34.19 
 
 
410 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1774  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
483 aa  156  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
451 aa  156  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  30.74 
 
 
477 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
367 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
483 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
370 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
380 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
464 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  34.92 
 
 
354 aa  150  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
471 aa  149  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
375 aa  149  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  31.6 
 
 
364 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  31.6 
 
 
364 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
354 aa  146  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
469 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
458 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
437 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
371 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>