More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3304 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  100 
 
 
514 aa  1045    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.91 
 
 
495 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  33.72 
 
 
518 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
518 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.04 
 
 
467 aa  276  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  41.36 
 
 
482 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
468 aa  266  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  32.16 
 
 
463 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  32.57 
 
 
471 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.3 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 
454 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  37.75 
 
 
516 aa  253  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  38.48 
 
 
465 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.62 
 
 
467 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.1 
 
 
461 aa  250  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.43 
 
 
467 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.43 
 
 
467 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.43 
 
 
467 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.43 
 
 
467 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.3 
 
 
467 aa  249  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  32.3 
 
 
467 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  32.3 
 
 
467 aa  249  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.3 
 
 
467 aa  249  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.83 
 
 
461 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.83 
 
 
461 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
483 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.3 
 
 
467 aa  249  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  32.3 
 
 
467 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.3 
 
 
467 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.3 
 
 
467 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.32 
 
 
512 aa  247  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.18 
 
 
457 aa  247  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
501 aa  247  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.72 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  32.63 
 
 
482 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.42 
 
 
453 aa  240  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
488 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
507 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  32.83 
 
 
499 aa  232  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.96 
 
 
460 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.86 
 
 
452 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  33.61 
 
 
455 aa  226  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  38.18 
 
 
472 aa  222  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
463 aa  217  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
425 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
527 aa  207  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  34.33 
 
 
423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  34.23 
 
 
529 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  33.02 
 
 
463 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  36.67 
 
 
470 aa  180  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
359 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  31.15 
 
 
593 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1774  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
483 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  36.84 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  31.03 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  32.64 
 
 
356 aa  174  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
358 aa  173  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
473 aa  173  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
723 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
483 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  32.36 
 
 
369 aa  169  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
458 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
394 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
395 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
382 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
463 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
383 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
369 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
451 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  30.79 
 
 
363 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
451 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3144  histidine kinase  33.51 
 
 
549 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
370 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
464 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
332 aa  161  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2934  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
458 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0322426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  32.49 
 
 
558 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  29.85 
 
 
592 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
379 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
379 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
394 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  30.88 
 
 
354 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
394 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
379 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
395 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
367 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  29.96 
 
 
360 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
639 aa  156  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
365 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
375 aa  156  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  29.43 
 
 
455 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
394 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
639 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  29.43 
 
 
455 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
459 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>