More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0313 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  100 
 
 
363 aa  711    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.96 
 
 
385 aa  349  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.22 
 
 
379 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.22 
 
 
379 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 
379 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.24 
 
 
395 aa  342  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.04 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.04 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 
379 aa  319  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.55 
 
 
381 aa  315  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.55 
 
 
381 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.95 
 
 
395 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.24 
 
 
394 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  51.52 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.52 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.27 
 
 
394 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.17 
 
 
380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 
389 aa  297  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 
389 aa  296  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.31 
 
 
370 aa  292  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4232  ATP-binding region ATPase domain protein  44.57 
 
 
410 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2605  ATP-binding region ATPase domain protein  44.57 
 
 
410 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.38 
 
 
332 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
375 aa  229  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  42.76 
 
 
356 aa  212  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
425 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
382 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 
380 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
383 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  39.58 
 
 
354 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  40.06 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  41.1 
 
 
423 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
359 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  37.28 
 
 
464 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
358 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.06 
 
 
467 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
473 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
451 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.69 
 
 
467 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.69 
 
 
467 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
463 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
451 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  38.93 
 
 
470 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  37.69 
 
 
467 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  37.69 
 
 
467 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  37.69 
 
 
467 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
354 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.69 
 
 
467 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.69 
 
 
467 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2938  ATPase domain-containing protein  38.89 
 
 
361 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  38.02 
 
 
360 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.94 
 
 
467 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.94 
 
 
467 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.94 
 
 
467 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.94 
 
 
467 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.94 
 
 
467 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.31 
 
 
467 aa  186  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  37.33 
 
 
463 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  38.3 
 
 
473 aa  185  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.5 
 
 
453 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 
365 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
359 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  37.07 
 
 
480 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
464 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  38.44 
 
 
518 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
518 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  33.22 
 
 
482 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
463 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 
723 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
507 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  31.23 
 
 
364 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.42 
 
 
512 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  31.23 
 
 
364 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.19 
 
 
467 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.29 
 
 
457 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2567  histidine kinase  38.42 
 
 
378 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0076552  hitchhiker  0.00389148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
463 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
487 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  37.36 
 
 
593 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  30.38 
 
 
466 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  30.38 
 
 
466 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  30.38 
 
 
466 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  30.38 
 
 
466 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
458 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.35 
 
 
455 aa  176  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  30.38 
 
 
466 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  34.73 
 
 
482 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  39.93 
 
 
469 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  30.09 
 
 
466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  29.79 
 
 
466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.47 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  30.09 
 
 
466 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
454 aa  173  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  38.63 
 
 
449 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.71 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.62 
 
 
460 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
483 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>