More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3963 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 454 aa  932    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.88 
 
 		 455 aa  282  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  35.43 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.29 
 
 		 457 aa  275  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.43 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.31 
 
 		 467 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 518 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  31.03 
 
 		 518 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.87 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  35.09 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  35.09 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.09 
 
 		 467 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.09 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.09 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.09 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  35.09 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.09 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.09 
 
 		 467 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.87 
 
 		 467 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.87 
 
 		 467 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.87 
 
 		 467 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.03 
 
 		 461 aa  263  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  39.14 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.59 
 
 		 461 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.59 
 
 		 461 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.96 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  30.97 
 
 		 463 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  31.68 
 
 		 480 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.31 
 
 		 512 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  30.51 
 
 		 471 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.89 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 488 aa  236  8e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 516 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  36.71 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 501 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  28.96 
 
 		 482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 463 aa  223  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  32.4 
 
 		 482 aa  220  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  31.58 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.78 
 
 		 495 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 507 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  34.44 
 
 		 529 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  36.39 
 
 		 499 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 457 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 483 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  33.56 
 
 		 423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 382 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  35.88 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  33.33 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 527 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  33.15 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  33.15 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  33.15 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  33.15 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  33.06 
 
 		 466 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  33.45 
 
 		 464 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  32.87 
 
 		 466 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  32.87 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  33.45 
 
 		 473 aa  177  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  30 
 
 		 363 aa  177  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3144  histidine kinase  34.69 
 
 		 549 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  32.72 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1774  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 483 aa  173  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  38.14 
 
 		 469 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  26.65 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  30.27 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  30.91 
 
 		 369 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  30.27 
 
 		 461 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 379 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  27.21 
 
 		 449 aa  170  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  30.07 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  31.94 
 
 		 593 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 358 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  31.35 
 
 		 356 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 464 aa  166  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 463 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>