More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1494 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
527 aa  1036    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0978  histidine kinase  60.19 
 
 
495 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947826  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.62 
 
 
510 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  48.79 
 
 
529 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3144  histidine kinase  60.8 
 
 
549 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
493 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.89 
 
 
461 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  36.45 
 
 
518 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
518 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.7 
 
 
461 aa  247  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.7 
 
 
461 aa  247  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  34.81 
 
 
465 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.1 
 
 
453 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.46 
 
 
467 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.59 
 
 
455 aa  229  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.17 
 
 
452 aa  229  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  31.54 
 
 
471 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.31 
 
 
512 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  36.12 
 
 
516 aa  226  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.08 
 
 
467 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.22 
 
 
457 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.46 
 
 
467 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.46 
 
 
467 aa  223  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  33.46 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  33.46 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  33.46 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.46 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.46 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
463 aa  220  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.27 
 
 
467 aa  219  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  31.78 
 
 
463 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.78 
 
 
467 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.59 
 
 
467 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  33.47 
 
 
482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.78 
 
 
467 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.78 
 
 
467 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.78 
 
 
467 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  30.28 
 
 
514 aa  216  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  29.46 
 
 
482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  34.03 
 
 
472 aa  213  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
468 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  40.45 
 
 
460 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  39.82 
 
 
480 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
488 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
425 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
507 aa  200  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  35.8 
 
 
463 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
379 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
379 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  34.07 
 
 
499 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
379 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
385 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
501 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  42.77 
 
 
423 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
454 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
381 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
381 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
379 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  31.19 
 
 
464 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  38.57 
 
 
369 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
389 aa  176  7e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
389 aa  176  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  31.64 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
463 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
483 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.63 
 
 
495 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
394 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
394 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  33.93 
 
 
356 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
380 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
395 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
483 aa  166  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
723 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
369 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  37.28 
 
 
593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
451 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  37.16 
 
 
354 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
451 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
471 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
367 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
464 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
471 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
437 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  36.92 
 
 
363 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
383 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
473 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
463 aa  156  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  33.54 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
358 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
408 aa  154  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  34.32 
 
 
470 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  34.69 
 
 
360 aa  153  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
380 aa  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
468 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  38.23 
 
 
594 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>