More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0968 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  100 
 
 		 455 aa  933    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  36.4 
 
 		 482 aa  279  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  32.99 
 
 		 480 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.59 
 
 		 467 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  43.5 
 
 		 516 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  35.51 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  35.51 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  35.51 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.51 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.51 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.51 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.08 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.29 
 
 		 467 aa  252  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.29 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 493 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.51 
 
 		 467 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  32.91 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.88 
 
 		 455 aa  246  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 518 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  32.86 
 
 		 518 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.61 
 
 		 457 aa  242  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 501 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.13 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.13 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.13 
 
 		 467 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.13 
 
 		 467 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.13 
 
 		 467 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.96 
 
 		 461 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.96 
 
 		 461 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.69 
 
 		 512 aa  233  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.96 
 
 		 461 aa  232  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 488 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  34.77 
 
 		 465 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  39.4 
 
 		 499 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.8 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  35.38 
 
 		 463 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  38.32 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  33.61 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.79 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 507 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 454 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.95 
 
 		 495 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  33.19 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 425 aa  204  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  34.65 
 
 		 463 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  37.59 
 
 		 470 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  34.81 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  32.81 
 
 		 529 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  33.74 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  35.85 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 473 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 483 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 451 aa  172  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1774  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 483 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 527 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  31.95 
 
 		 468 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 723 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0978  histidine kinase  29.87 
 
 		 495 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00300746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  32.89 
 
 		 593 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 364 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  32.26 
 
 		 558 aa  156  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  31.49 
 
 		 364 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  31.49 
 
 		 364 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 473 aa  153  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 467 aa  153  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 385 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  31.15 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  34.27 
 
 		 501 aa  151  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1791  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.813908  normal  0.38268 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  30 
 
 		 466 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  33.93 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  33.93 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  33.93 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  33.93 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  33.93 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 504 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  34.11 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  28.62 
 
 		 518 aa  150  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  33.09 
 
 		 466 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 383 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  33.09 
 
 		 466 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  29.27 
 
 		 464 aa  149  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  30.69 
 
 		 594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>