More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1287 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 504 aa  1023    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  53.47 
 
 		 508 aa  518  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  43.71 
 
 		 467 aa  273  7e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  44.64 
 
 		 469 aa  269  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  38.56 
 
 		 465 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 639 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 639 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  36.83 
 
 		 463 aa  223  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 639 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 382 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 459 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  35.16 
 
 		 466 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  35.8 
 
 		 347 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  34.87 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  36.77 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  35.12 
 
 		 466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  35.12 
 
 		 466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  35.12 
 
 		 466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  35.12 
 
 		 466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  35.33 
 
 		 351 aa  211  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 466 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  35.33 
 
 		 351 aa  211  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 466 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  34.72 
 
 		 351 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  33.33 
 
 		 356 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  34.48 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 641 aa  207  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 455 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 455 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  35.11 
 
 		 357 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  37.37 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  37.37 
 
 		 484 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2181  sensor histidine kinase  34.76 
 
 		 507 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.547096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 357 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  33.53 
 
 		 466 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  38.51 
 
 		 496 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  37.37 
 
 		 484 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  37.37 
 
 		 484 aa  203  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  37.37 
 
 		 484 aa  203  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  34.46 
 
 		 357 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  33.43 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1892  sensor histidine kinase  34.47 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  36.65 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  36.68 
 
 		 484 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  36.68 
 
 		 484 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 464 aa  199  7.999999999999999e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  41.18 
 
 		 253 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  34.25 
 
 		 310 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  31.61 
 
 		 473 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  36.23 
 
 		 470 aa  196  6e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1260  Signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 483 aa  196  7e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000444987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  33.52 
 
 		 603 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  33.24 
 
 		 603 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  33.24 
 
 		 603 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 614 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  33.24 
 
 		 603 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  33.24 
 
 		 603 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  33.24 
 
 		 603 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  33.24 
 
 		 603 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 601 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  36.23 
 
 		 391 aa  193  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 458 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 462 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 		 571 aa  192  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1517  sensor histidine kinase  33.14 
 
 		 604 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  32.63 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  32.95 
 
 		 603 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 640 aa  191  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  32.86 
 
 		 604 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  32.33 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  32.33 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 614 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  32.33 
 
 		 458 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  35.64 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  35.77 
 
 		 473 aa  190  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  31.12 
 
 		 468 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  32.95 
 
 		 357 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  30.82 
 
 		 463 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 597 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 451 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>