More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2496 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  100 
 
 		 469 aa  934    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  41.69 
 
 		 508 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  33.05 
 
 		 467 aa  240  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  34.84 
 
 		 465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 487 aa  210  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 459 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  37.01 
 
 		 473 aa  189  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  35.29 
 
 		 466 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  28.66 
 
 		 496 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  34.43 
 
 		 468 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 466 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 473 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 466 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.54 
 
 		 470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  33.55 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 468 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2158  histidine kinase  29.32 
 
 		 536 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0596427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 466 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 466 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 571 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  31.8 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 359 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 473 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  31.72 
 
 		 354 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 723 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  30.33 
 
 		 449 aa  173  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  32.7 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 458 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 358 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 639 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  29.02 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 603 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 603 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 603 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.95 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  35.82 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 639 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  29.67 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.32 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  30.35 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 493 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 601 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  30.35 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.72 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  30.04 
 
 		 458 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  30.04 
 
 		 458 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 493 aa  163  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  28.66 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  28.66 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  28.96 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  28.96 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 639 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  28.66 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  28.86 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  40.09 
 
 		 537 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  28.66 
 
 		 484 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  30.25 
 
 		 458 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  30.56 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  28.66 
 
 		 484 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  30.75 
 
 		 603 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2181  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 507 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.547096  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1892  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 507 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  24.81 
 
 		 455 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  30.75 
 
 		 603 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  32.22 
 
 		 516 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  30.94 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  33.58 
 
 		 482 aa  160  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 584 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 458 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.91 
 
 		 461 aa  160  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 584 aa  160  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.91 
 
 		 461 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30 
 
 		 467 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  30.75 
 
 		 603 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30 
 
 		 467 aa  160  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 469 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.62 
 
 		 461 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 518 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 604 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  28.92 
 
 		 518 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>