More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3119 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  100 
 
 		 516 aa  1033    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.66 
 
 		 493 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  52.29 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  49.59 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.72 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.72 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.72 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.72 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 518 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  42.22 
 
 		 518 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  44.42 
 
 		 467 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 468 aa  350  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  44.21 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  43.79 
 
 		 467 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  44 
 
 		 467 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  44 
 
 		 467 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  44 
 
 		 467 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  44 
 
 		 467 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  44 
 
 		 467 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  40.37 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  43.79 
 
 		 467 aa  343  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  40.04 
 
 		 457 aa  342  8e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  42.26 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  42.44 
 
 		 467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.89 
 
 		 512 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  40.34 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  40.93 
 
 		 463 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  42.95 
 
 		 467 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  42.74 
 
 		 467 aa  329  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  42.95 
 
 		 467 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  42.95 
 
 		 467 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  42.74 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.99 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  36.19 
 
 		 482 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  42.37 
 
 		 472 aa  314  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 507 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  33.13 
 
 		 471 aa  279  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.07 
 
 		 495 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  35.04 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 483 aa  267  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 488 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  33.27 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  43.5 
 
 		 455 aa  261  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  36.38 
 
 		 529 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 527 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0978  histidine kinase  36.8 
 
 		 495 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 471 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  40.98 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 359 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.25 
 
 		 463 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  37.25 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1774  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 483 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 382 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 365 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  25.69 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 723 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 358 aa  183  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 473 aa  180  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  37.99 
 
 		 593 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 483 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  32.44 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  32.53 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  32.53 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  33.22 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 466 aa  177  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 383 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  37.06 
 
 		 354 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  38.16 
 
 		 369 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  34.55 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  38.23 
 
 		 592 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  33.22 
 
 		 466 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 389 aa  173  9e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  29.77 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  37.22 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 389 aa  172  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 370 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 451 aa  171  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 464 aa  171  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  32.78 
 
 		 466 aa  171  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 473 aa  170  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>