More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0392 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  100 
 
 
449 aa  881    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 
483 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 
483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  35 
 
 
473 aa  260  3e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.96 
 
 
470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
473 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
458 aa  230  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  39.82 
 
 
469 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
471 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 
425 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
471 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
458 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  37.46 
 
 
364 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  37.46 
 
 
364 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
453 aa  209  8e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
364 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  44.6 
 
 
423 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 
365 aa  206  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  33.85 
 
 
463 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  37.83 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  26.92 
 
 
464 aa  200  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  37.58 
 
 
391 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
723 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.26 
 
 
463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.88 
 
 
467 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.88 
 
 
467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
371 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.2 
 
 
467 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 
473 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  30.19 
 
 
465 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  32.65 
 
 
467 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  32.65 
 
 
467 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  32.65 
 
 
467 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.65 
 
 
467 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.65 
 
 
467 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  36.39 
 
 
593 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
382 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
487 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 
359 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.42 
 
 
467 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.61 
 
 
460 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
463 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  37.22 
 
 
518 aa  189  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
518 aa  189  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.38 
 
 
453 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
383 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  40.35 
 
 
354 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
493 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  34.64 
 
 
508 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
332 aa  187  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.95 
 
 
467 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.72 
 
 
467 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31 
 
 
467 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.95 
 
 
467 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.72 
 
 
467 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.72 
 
 
467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  27.98 
 
 
471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  40 
 
 
360 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  40.82 
 
 
592 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  33.74 
 
 
455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  35.92 
 
 
501 aa  183  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  35.31 
 
 
496 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
504 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
639 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.75 
 
 
461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 
380 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  39.49 
 
 
558 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
589 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.52 
 
 
455 aa  180  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  37.25 
 
 
516 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
367 aa  180  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  39.93 
 
 
594 aa  180  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
379 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
379 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
358 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
463 aa  179  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
394 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
310 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
464 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
370 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.52 
 
 
461 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.52 
 
 
461 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  28.1 
 
 
473 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
379 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
385 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.14 
 
 
486 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
468 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
641 aa  177  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
462 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.02 
 
 
457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 
590 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>