More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0303 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  100 
 
 
360 aa  724    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.27 
 
 
365 aa  442  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.87 
 
 
359 aa  353  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.88 
 
 
354 aa  351  8.999999999999999e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.76 
 
 
367 aa  331  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.75 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
382 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  39.89 
 
 
391 aa  248  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.75 
 
 
359 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  41.37 
 
 
356 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
371 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  44.36 
 
 
354 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
358 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
364 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  36.44 
 
 
364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  36.44 
 
 
364 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
379 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
483 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 
394 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 
394 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  37.88 
 
 
369 aa  206  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
381 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
381 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
379 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
379 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
394 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
385 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
471 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
369 aa  199  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 
589 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
425 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
473 aa  195  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
380 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
389 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
395 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2605  ATP-binding region ATPase domain protein  35.8 
 
 
410 aa  193  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4232  ATP-binding region ATPase domain protein  35.74 
 
 
410 aa  193  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  35.28 
 
 
466 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  34.95 
 
 
466 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
483 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
395 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  39.56 
 
 
593 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  33.98 
 
 
466 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  33.98 
 
 
466 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  33.98 
 
 
466 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  33.98 
 
 
466 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  33.98 
 
 
466 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  38.19 
 
 
423 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  33.66 
 
 
466 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
471 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  41.91 
 
 
587 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  36.96 
 
 
464 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  33.66 
 
 
466 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  41.91 
 
 
587 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  41.91 
 
 
587 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  41.91 
 
 
587 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  37.99 
 
 
363 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  41.91 
 
 
587 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
487 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  41.49 
 
 
587 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  30.13 
 
 
508 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
394 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
473 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  35.91 
 
 
466 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  41.49 
 
 
587 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  41.49 
 
 
587 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  40 
 
 
449 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2938  ATPase domain-containing protein  37.33 
 
 
361 aa  186  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 
458 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
587 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  41.49 
 
 
587 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
639 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  38.28 
 
 
463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  37.54 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
639 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 
723 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
457 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  39.37 
 
 
558 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  37.63 
 
 
470 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
504 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  38.27 
 
 
473 aa  182  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.41 
 
 
457 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  30.07 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
585 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
458 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
464 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
375 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.27 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
639 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
468 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  41.11 
 
 
537 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.67 
 
 
452 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.13 
 
 
453 aa  179  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
585 aa  179  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  37.09 
 
 
496 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  37.19 
 
 
501 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>