More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3062 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 458 aa  931    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  36.81 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  34.89 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.52 
 
 		 461 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.29 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.29 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.82 
 
 		 460 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.03 
 
 		 467 aa  219  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 465 aa  216  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 458 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 507 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  42.96 
 
 		 593 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.83 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.79 
 
 		 455 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.04 
 
 		 467 aa  209  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.04 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  34.04 
 
 		 467 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  34.04 
 
 		 467 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  34.04 
 
 		 467 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.04 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 483 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  28.36 
 
 		 463 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.04 
 
 		 467 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.04 
 
 		 467 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.25 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  39.68 
 
 		 473 aa  207  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.83 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.48 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.47 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 493 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.83 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  31.16 
 
 		 470 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.62 
 
 		 467 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.62 
 
 		 467 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  29.18 
 
 		 464 aa  206  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 483 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  34.03 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 473 aa  204  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.04 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.77 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  44.16 
 
 		 594 aa  200  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  37.34 
 
 		 391 aa  199  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 504 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  37.39 
 
 		 518 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 518 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  41.67 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  38.86 
 
 		 469 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  33.48 
 
 		 472 aa  193  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 359 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  35.15 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 723 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 389 aa  190  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  34.37 
 
 		 482 aa  189  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 358 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  38.51 
 
 		 558 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  31.01 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  40.36 
 
 		 369 aa  187  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  40.44 
 
 		 360 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  36.93 
 
 		 360 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.15 
 
 		 310 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 463 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  37.23 
 
 		 354 aa  183  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 369 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  31.23 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 468 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  35.33 
 
 		 455 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  38.85 
 
 		 363 aa  180  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 589 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 500 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  38.52 
 
 		 516 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  32.44 
 
 		 456 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  36.36 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  36.36 
 
 		 364 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>