More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04930 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  97.94 
 
 
389 aa  735    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
389 aa  785    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.63 
 
 
370 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 
379 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 
381 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 
381 aa  298  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  46.04 
 
 
363 aa  295  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
385 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 
395 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  48.59 
 
 
369 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.63 
 
 
369 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
394 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
394 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
394 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
380 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 
395 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  56.03 
 
 
332 aa  259  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
394 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4232  ATP-binding region ATPase domain protein  40.62 
 
 
410 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2605  ATP-binding region ATPase domain protein  40.34 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 
375 aa  245  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 
367 aa  215  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
359 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
723 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  43.46 
 
 
593 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.79 
 
 
471 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
471 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 
365 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
354 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  34.7 
 
 
364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  34.43 
 
 
364 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
425 aa  199  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  41.61 
 
 
558 aa  199  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
473 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  39.71 
 
 
473 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  41.79 
 
 
360 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  38 
 
 
463 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  42.6 
 
 
594 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
483 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  39.71 
 
 
470 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
458 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  34.41 
 
 
463 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
458 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
364 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  40.75 
 
 
423 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.86 
 
 
452 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  39.53 
 
 
356 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
382 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
383 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  40.29 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
371 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
487 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
463 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  33.82 
 
 
464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
451 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2307  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
666 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.12 
 
 
457 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
464 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.51 
 
 
467 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  30.98 
 
 
310 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  39.32 
 
 
529 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  37.71 
 
 
465 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
459 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.25 
 
 
467 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.14 
 
 
467 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  35.49 
 
 
592 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  39.66 
 
 
328 aa  175  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  35.14 
 
 
467 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  35.14 
 
 
467 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  35.14 
 
 
467 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.14 
 
 
467 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.14 
 
 
467 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.59 
 
 
453 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  30.23 
 
 
473 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  39.93 
 
 
469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
527 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  39.29 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  37.38 
 
 
449 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.78 
 
 
467 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
358 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
483 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  37.14 
 
 
496 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
454 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.68 
 
 
455 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  31.06 
 
 
518 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  37.73 
 
 
354 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  33.01 
 
 
466 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  33.01 
 
 
466 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  33.01 
 
 
466 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  33.01 
 
 
466 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  33.01 
 
 
466 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
463 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>