More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3144 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3144  histidine kinase  100 
 
 
549 aa  1070    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.69 
 
 
527 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0978  histidine kinase  51.09 
 
 
495 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947826  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.09 
 
 
510 aa  415  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  46.28 
 
 
529 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  34.8 
 
 
518 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
518 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  42.13 
 
 
480 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.44 
 
 
461 aa  216  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  41.57 
 
 
453 aa  213  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.19 
 
 
461 aa  213  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.19 
 
 
461 aa  213  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.17 
 
 
455 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.05 
 
 
467 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.15 
 
 
467 aa  208  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  34.1 
 
 
471 aa  207  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.9 
 
 
467 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  40.7 
 
 
457 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.29 
 
 
467 aa  205  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.49 
 
 
467 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.49 
 
 
467 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.23 
 
 
467 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
463 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.23 
 
 
467 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.97 
 
 
467 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  38.6 
 
 
467 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  38.6 
 
 
467 aa  203  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.6 
 
 
467 aa  203  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.6 
 
 
467 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  38.6 
 
 
467 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  38.65 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  39.25 
 
 
482 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  31.67 
 
 
465 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.07 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  29.49 
 
 
514 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  39.89 
 
 
460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
468 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
454 aa  191  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.68 
 
 
495 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
463 aa  186  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  38.85 
 
 
472 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  40.44 
 
 
516 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
501 aa  183  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  26.47 
 
 
482 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 
488 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
425 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
507 aa  177  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.71 
 
 
512 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  41.02 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  40.82 
 
 
423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
379 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
379 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
379 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  36.68 
 
 
470 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  38.6 
 
 
473 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
385 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
389 aa  167  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
395 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
389 aa  167  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  30.91 
 
 
455 aa  166  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.78 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
483 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
369 aa  163  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
394 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
437 aa  161  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  34.83 
 
 
499 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
394 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
367 aa  156  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  36.69 
 
 
593 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
394 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
394 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
463 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
471 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  38.91 
 
 
360 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
483 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  31.08 
 
 
464 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
395 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1105  signal transduction histidine kinase-like protein  39.15 
 
 
1141 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
379 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  37.5 
 
 
354 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
453 aa  150  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
463 aa  150  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
381 aa  150  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
381 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
380 aa  150  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1774  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  36.53 
 
 
363 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  35.39 
 
 
356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
382 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
458 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
451 aa  147  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
723 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
383 aa  147  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  32.28 
 
 
466 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
639 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  33.23 
 
 
466 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  35.49 
 
 
558 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>