More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3082 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  100 
 
 		 477 aa  968    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 		 470 aa  356  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  42.89 
 
 		 469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 		 469 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 459 aa  251  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.76 
 
 		 486 aa  231  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.53 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 462 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 484 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  36.59 
 
 		 461 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  37.9 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  31.08 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 447 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 455 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  33.76 
 
 		 469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  32.42 
 
 		 471 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 474 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  33.13 
 
 		 490 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 504 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 489 aa  210  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.49 
 
 		 481 aa  210  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 480 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 509 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 469 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  40.29 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  30.29 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 473 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 456 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.24 
 
 		 468 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  42.29 
 
 		 475 aa  202  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  39.48 
 
 		 470 aa  202  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 462 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  38.57 
 
 		 459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.46 
 
 		 462 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.77 
 
 		 477 aa  196  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 515 aa  196  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  39.08 
 
 		 460 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  40.13 
 
 		 463 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 477 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 495 aa  195  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  29.64 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 475 aa  194  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  36.24 
 
 		 357 aa  193  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 469 aa  192  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 465 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  29.65 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 477 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 473 aa  191  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  36.76 
 
 		 455 aa  190  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  29.65 
 
 		 484 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 469 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 551 aa  190  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0818729  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 500 aa  189  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.57 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  33.9 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  35.86 
 
 		 357 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.09 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  29.1 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 487 aa  187  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 465 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 469 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 457 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  28.95 
 
 		 482 aa  186  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  31.2 
 
 		 463 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 457 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  37.19 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  28.95 
 
 		 482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  34.81 
 
 		 472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  36.46 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  28.33 
 
 		 482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  36.46 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  36.46 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  36.46 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  29.42 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>