More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5524 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  100 
 
 
857 aa  1687    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  55.96 
 
 
328 aa  323  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  55.49 
 
 
343 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.76 
 
 
396 aa  306  9.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  49.17 
 
 
389 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  51.65 
 
 
360 aa  291  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  50.41 
 
 
1162 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1275  histidine kinase  50.27 
 
 
395 aa  290  7e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.207419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.71 
 
 
367 aa  282  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09570  signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
382 aa  272  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  50.75 
 
 
347 aa  271  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  48.54 
 
 
363 aa  266  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  41.47 
 
 
391 aa  246  9.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
357 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6210  hypothetical protein  41.01 
 
 
493 aa  191  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3486  hypothetical protein  42.5 
 
 
604 aa  188  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.621993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3567  hypothetical protein  37.5 
 
 
474 aa  185  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.85 
 
 
461 aa  184  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  34.74 
 
 
466 aa  183  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  34.74 
 
 
466 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  33.66 
 
 
466 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  33.88 
 
 
466 aa  183  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  33.88 
 
 
466 aa  183  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  33.88 
 
 
466 aa  183  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  33.88 
 
 
466 aa  183  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  33.88 
 
 
466 aa  183  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  33.66 
 
 
466 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.15 
 
 
461 aa  179  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.15 
 
 
461 aa  179  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
471 aa  178  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
470 aa  177  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  33.22 
 
 
466 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  33.77 
 
 
468 aa  173  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.43 
 
 
455 aa  173  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
466 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.59 
 
 
457 aa  173  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
459 aa  173  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
458 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
493 aa  171  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
473 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
458 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
468 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.38 
 
 
467 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.51 
 
 
467 aa  168  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  34.19 
 
 
508 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  37.35 
 
 
593 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  36.01 
 
 
482 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  37.93 
 
 
518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.4 
 
 
467 aa  166  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
425 aa  165  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  35.4 
 
 
467 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  35.4 
 
 
467 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.4 
 
 
467 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  35.4 
 
 
467 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.4 
 
 
467 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  37.04 
 
 
496 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
359 aa  164  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  35 
 
 
465 aa  164  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.8 
 
 
467 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.8 
 
 
467 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.8 
 
 
467 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.04 
 
 
467 aa  164  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.8 
 
 
467 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.04 
 
 
467 aa  164  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.8 
 
 
467 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  36.46 
 
 
463 aa  164  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
496 aa  164  9e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  34.78 
 
 
470 aa  163  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.33 
 
 
460 aa  163  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
466 aa  163  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  36.36 
 
 
473 aa  162  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
389 aa  160  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.81 
 
 
512 aa  159  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
359 aa  159  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
364 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
358 aa  158  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
451 aa  158  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  29.79 
 
 
482 aa  158  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
504 aa  158  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
395 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
365 aa  158  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
483 aa  158  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
451 aa  157  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.52 
 
 
452 aa  157  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
493 aa  157  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
639 aa  157  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0432  signal transduction histidine kinase-like protein  40.06 
 
 
434 aa  157  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.986525  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  30.68 
 
 
518 aa  157  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  35.05 
 
 
480 aa  157  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
389 aa  155  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
385 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  37.34 
 
 
465 aa  156  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
639 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
639 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
487 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  35.47 
 
 
364 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  35.43 
 
 
391 aa  155  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>