More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1862 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 349 aa  703    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  37.8 
 
 		 455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0957  Signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 355 aa  212  9e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  35.33 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  37.67 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  37.67 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  36.99 
 
 		 458 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  37.33 
 
 		 458 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  37.88 
 
 		 458 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  36.99 
 
 		 458 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  36.99 
 
 		 458 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  36.99 
 
 		 458 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  37.54 
 
 		 458 aa  202  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  36.64 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  30.64 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1772  Signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  33.9 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  35.46 
 
 		 357 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  39.1 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  33.24 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0124  sensor histidine kinase  34.57 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  34.33 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  34.33 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  34.11 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  34.11 
 
 		 351 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  35.78 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 463 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  31.25 
 
 		 465 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  30.87 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  30.87 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 614 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  30.61 
 
 		 481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  34.72 
 
 		 508 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  30.27 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0495  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 487 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0640  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 487 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  30.27 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0710  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0553  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 487 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0497  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0584  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 487 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 613 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  31.1 
 
 		 488 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 459 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  30.98 
 
 		 456 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  31.06 
 
 		 462 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  29.25 
 
 		 487 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 614 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 463 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  30.34 
 
 		 491 aa  153  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  34.03 
 
 		 471 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  30.3 
 
 		 463 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 476 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 504 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  32.53 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  32.99 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 464 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 641 aa  146  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  32.07 
 
 		 453 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000747291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  31.86 
 
 		 458 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 477 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  31.72 
 
 		 453 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  31.72 
 
 		 453 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  31.72 
 
 		 453 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  31.72 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  31.72 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 468 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  29.7 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 467 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1260  Signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 483 aa  143  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000444987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 513 aa  143  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 815 aa  143  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  29.37 
 
 		 466 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  29.37 
 
 		 466 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  29.37 
 
 		 466 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  29.37 
 
 		 466 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 396 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 639 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 592 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  27.64 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  31.96 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>