14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3567 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3567  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  922    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  38.71 
 
 		 857 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.64 
 
 		 1162 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6210  hypothetical protein  37.65 
 
 		 493 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3486  hypothetical protein  38.46 
 
 		 604 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.621993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0432  signal transduction histidine kinase-like protein  33.02 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.986525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4871  hypothetical protein  30.86 
 
 		 493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3418  hypothetical protein  21.77 
 
 		 523 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.377883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11570  hypothetical protein  28.82 
 
 		 527 aa  61.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3303  hypothetical protein  29.45 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124678  normal  0.407107 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6331  hypothetical protein  32.24 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00569126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4323  hypothetical protein  25.82 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3102  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  48.08 
 
 		 440 aa  43.5  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>