30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43450 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  100 
 
 
467 aa  946    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46378  predicted protein  46.38 
 
 
509 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49209  predicted protein  40 
 
 
526 aa  229  6e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0370698  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1270  hypothetical protein  32.16 
 
 
307 aa  87.4  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16390  hypothetical protein  28.31 
 
 
188 aa  60.1  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.244545 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  34.82 
 
 
840 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  39.63 
 
 
590 aa  53.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  39.47 
 
 
582 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  39.2 
 
 
504 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  38.22 
 
 
1000 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  39.5 
 
 
551 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.03 
 
 
830 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43213  predicted protein  24.85 
 
 
819 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  40.18 
 
 
555 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47888  predicted protein  41.18 
 
 
854 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.554333  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 
261 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  32.18 
 
 
1821 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2008  putative lipoprotein  24.79 
 
 
267 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44593  predicted protein  24.59 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  36.7 
 
 
521 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  27.62 
 
 
453 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  26.35 
 
 
926 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47575  predicted protein  35.62 
 
 
744 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759441  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  40.54 
 
 
488 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  28.12 
 
 
630 aa  44.3  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  40.65 
 
 
136 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  35.77 
 
 
633 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46569  predicted protein  33.82 
 
 
818 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61135  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  31.2 
 
 
479 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42459  predicted protein  46.15 
 
 
557 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>