76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48253 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  100 
 
 		 1461 aa  2965    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  38.59 
 
 		 1656 aa  194  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  33.44 
 
 		 326 aa  156  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  33 
 
 		 321 aa  149  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  43.58 
 
 		 1000 aa  132  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  30.06 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  30.48 
 
 		 321 aa  92.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  30.33 
 
 		 321 aa  92.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  35.58 
 
 		 2170 aa  90.1  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  29 
 
 		 317 aa  90.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  27.78 
 
 		 344 aa  84.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  26 
 
 		 341 aa  76.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1231  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1049 aa  75.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.001634  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  37.78 
 
 		 648 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1170 aa  72.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  33.98 
 
 		 590 aa  72.8  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  33.71 
 
 		 2706 aa  71.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1853 aa  68.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  32.88 
 
 		 1762 aa  67  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  24.66 
 
 		 795 aa  66.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  27.62 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  27.37 
 
 		 993 aa  64.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1853 aa  65.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 454 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  28.75 
 
 		 373 aa  63.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  26.34 
 
 		 630 aa  62.8  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  27.72 
 
 		 334 aa  63.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47260  predicted protein  40.7 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.776237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  27.59 
 
 		 990 aa  62.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1557 aa  62.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  32 
 
 		 970 aa  60.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.91 
 
 		 2313 aa  60.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2792  hypothetical protein  37.5 
 
 		 938 aa  60.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  34.07 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  32.91 
 
 		 662 aa  59.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  30.11 
 
 		 776 aa  59.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  26.94 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.84 
 
 		 1501 aa  59.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  30.57 
 
 		 1667 aa  58.9  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  34.01 
 
 		 1574 aa  58.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  41.91 
 
 		 1567 aa  58.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  26.72 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  27.4 
 
 		 646 aa  57  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 1009 aa  56.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  27.65 
 
 		 1009 aa  56.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  29.33 
 
 		 504 aa  57  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47888  predicted protein  35.34 
 
 		 854 aa  56.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.554333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 461 aa  55.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46569  predicted protein  29.91 
 
 		 818 aa  55.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1407 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47575  predicted protein  41.75 
 
 		 744 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  31.86 
 
 		 1171 aa  54.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  27.52 
 
 		 318 aa  53.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 508 aa  53.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  35.29 
 
 		 479 aa  53.9  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  27.3 
 
 		 1017 aa  53.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  29.2 
 
 		 1222 aa  52.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  27.45 
 
 		 933 aa  52.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  29.8 
 
 		 1175 aa  52  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  27.72 
 
 		 586 aa  52  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  28.57 
 
 		 314 aa  51.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.77 
 
 		 830 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  24.54 
 
 		 717 aa  50.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  22.61 
 
 		 366 aa  50.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  25 
 
 		 484 aa  48.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  25 
 
 		 840 aa  48.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  33.06 
 
 		 524 aa  47.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  27.08 
 
 		 812 aa  48.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  28.7 
 
 		 136 aa  46.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  25.45 
 
 		 450 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  39.25 
 
 		 467 aa  46.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1514 aa  46.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  24.26 
 
 		 346 aa  45.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  27.12 
 
 		 483 aa  45.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  23.75 
 
 		 471 aa  45.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  26.27 
 
 		 1744 aa  45.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>