79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1232 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 2706 aa  5437    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  36.95 
 
 		 3802 aa  592  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  46.86 
 
 		 1193 aa  460  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  39.58 
 
 		 970 aa  213  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  31.92 
 
 		 1762 aa  187  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1231  NHL repeat-containing protein  32.21 
 
 		 1049 aa  180  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.001634  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  32.09 
 
 		 812 aa  125  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  28.31 
 
 		 2170 aa  115  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1574 aa  101  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1853 aa  95.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1853 aa  94.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  36.63 
 
 		 516 aa  84  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  26.43 
 
 		 1656 aa  82.8  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  33.71 
 
 		 1461 aa  71.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2792  hypothetical protein  32.28 
 
 		 938 aa  69.3  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  32.37 
 
 		 524 aa  68.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1170 aa  67  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  49.09 
 
 		 830 aa  66.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  29.03 
 
 		 1667 aa  65.9  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  55.41 
 
 		 433 aa  65.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.51 
 
 		 1200 aa  65.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  55.65 
 
 		 1394 aa  63.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1229  PKD domain-containing protein  38.64 
 
 		 675 aa  63.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  27.2 
 
 		 430 aa  63.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  29.44 
 
 		 408 aa  60.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  30.08 
 
 		 848 aa  60.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  38.84 
 
 		 503 aa  58.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.86 
 
 		 911 aa  58.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  39.32 
 
 		 503 aa  58.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  33.51 
 
 		 662 aa  58.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.57 
 
 		 913 aa  58.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  26.09 
 
 		 1138 aa  56.6  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  43.48 
 
 		 1011 aa  56.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.07 
 
 		 1217 aa  56.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.43 
 
 		 1212 aa  56.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  34.69 
 
 		 746 aa  55.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  27.72 
 
 		 342 aa  55.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  29.28 
 
 		 820 aa  55.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  30 
 
 		 868 aa  54.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  44.57 
 
 		 855 aa  54.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  30.95 
 
 		 868 aa  54.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  46.59 
 
 		 356 aa  53.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  30.48 
 
 		 868 aa  53.9  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  38.02 
 
 		 665 aa  53.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  39.56 
 
 		 1107 aa  53.5  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  38.61 
 
 		 1418 aa  53.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  35.04 
 
 		 826 aa  52.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  36.36 
 
 		 1171 aa  51.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  50.5 
 
 		 605 aa  52  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  48 
 
 		 456 aa  50.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 		 846 aa  50.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  41.75 
 
 		 916 aa  50.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.19 
 
 		 2313 aa  50.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  35.51 
 
 		 671 aa  50.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2229  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1018 aa  49.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394559  normal  0.0986595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  52.31 
 
 		 914 aa  49.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  36.36 
 
 		 665 aa  49.7  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 1175 aa  49.7  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  25.91 
 
 		 908 aa  49.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  42.27 
 
 		 1750 aa  48.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  25.69 
 
 		 585 aa  49.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  49.51 
 
 		 778 aa  48.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  35.48 
 
 		 457 aa  48.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  36.04 
 
 		 994 aa  48.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  33.68 
 
 		 1258 aa  48.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  40 
 
 		 625 aa  48.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  38.95 
 
 		 848 aa  47.8  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  49.49 
 
 		 453 aa  47.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  42.55 
 
 		 712 aa  47.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  29.76 
 
 		 868 aa  47.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 		 868 aa  47.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.04 
 
 		 726 aa  47  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  27.73 
 
 		 381 aa  47  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.56 
 
 		 1292 aa  47  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  43.37 
 
 		 259 aa  46.6  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  25.09 
 
 		 676 aa  46.2  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  26.02 
 
 		 482 aa  46.2  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  24.89 
 
 		 400 aa  46.2  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  25.38 
 
 		 933 aa  45.8  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>