29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2792 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2792  hypothetical protein  100 
 
 
938 aa  1905    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2775  hypothetical protein  52.61 
 
 
1201 aa  632  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  55.26 
 
 
1762 aa  128  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  37.8 
 
 
524 aa  90.1  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  35.16 
 
 
933 aa  81.3  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  44.21 
 
 
662 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  35.09 
 
 
1170 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  38.06 
 
 
1574 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  40.37 
 
 
1853 aa  75.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  41.28 
 
 
1853 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  37.68 
 
 
970 aa  75.1  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  42.2 
 
 
503 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  40.8 
 
 
503 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1515  hypothetical protein  28.42 
 
 
586 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  32.19 
 
 
2706 aa  68.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  32.45 
 
 
2170 aa  66.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  33.88 
 
 
1171 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  37.5 
 
 
1461 aa  60.1  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  33.33 
 
 
3802 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  37.86 
 
 
1175 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02460  hypothetical protein  29.53 
 
 
795 aa  58.5  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2229  hypothetical protein  26.99 
 
 
1018 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394559  normal  0.0986595 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  27.08 
 
 
1667 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 
469 aa  53.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.42 
 
 
1501 aa  52  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1231  NHL repeat-containing protein  33.05 
 
 
1049 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.001634  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.34 
 
 
862 aa  48.5  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1081  hypothetical protein  27.61 
 
 
853 aa  48.9  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 
888 aa  45.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>