13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2229 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2229  hypothetical protein  100 
 
 		 1018 aa  2049    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394559  normal  0.0986595 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1762 aa  55.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2792  hypothetical protein  26.99 
 
 		 938 aa  54.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  30.58 
 
 		 524 aa  51.6  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  29.89 
 
 		 970 aa  51.2  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  23.33 
 
 		 933 aa  50.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  35.96 
 
 		 2170 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  34.94 
 
 		 1170 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  30.38 
 
 		 2706 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 469 aa  47.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1574 aa  46.6  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  29.09 
 
 		 1667 aa  45.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.8 
 
 		 862 aa  45.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>