More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2426 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  96.22 
 
 
503 aa  941    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
503 aa  973    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  78.98 
 
 
462 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  52.87 
 
 
448 aa  353  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  88.31 
 
 
1574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  81.76 
 
 
1853 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  81.76 
 
 
1853 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  38.55 
 
 
1029 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.55 
 
 
1029 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  43.86 
 
 
2954 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  37.46 
 
 
3209 aa  163  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.87 
 
 
1415 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  36.75 
 
 
395 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  36.45 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 
2198 aa  154  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  42.91 
 
 
3954 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  44.14 
 
 
768 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  37.84 
 
 
2133 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  45.7 
 
 
3608 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  40.24 
 
 
907 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  44.53 
 
 
2807 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  42.21 
 
 
851 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  42.26 
 
 
1764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  47.27 
 
 
3619 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  47.58 
 
 
4334 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.88 
 
 
3619 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  34 
 
 
1019 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  41.13 
 
 
1855 aa  137  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  40.46 
 
 
2467 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  36.86 
 
 
824 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  43 
 
 
1532 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.03 
 
 
1534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  39.15 
 
 
727 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  44.04 
 
 
1133 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 
1610 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  37.29 
 
 
1197 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  39.68 
 
 
3026 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  31.45 
 
 
2701 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.42 
 
 
1180 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  37.21 
 
 
1134 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  32.37 
 
 
1839 aa  106  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  43.13 
 
 
1610 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  35.44 
 
 
820 aa  104  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  38.03 
 
 
467 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  32.3 
 
 
574 aa  103  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  38.6 
 
 
1557 aa  101  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  35.86 
 
 
546 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  33.24 
 
 
1582 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  37.45 
 
 
475 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  33.07 
 
 
2567 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  38.64 
 
 
475 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  36.81 
 
 
2097 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  37.84 
 
 
2950 aa  98.2  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.12 
 
 
588 aa  97.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.78 
 
 
1403 aa  97.1  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  34.72 
 
 
745 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  32.62 
 
 
1037 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  30.52 
 
 
998 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.56 
 
 
2667 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  32.26 
 
 
795 aa  90.9  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  36.76 
 
 
946 aa  90.5  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  33.72 
 
 
357 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  34.77 
 
 
648 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.3 
 
 
998 aa  88.6  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  34.66 
 
 
329 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  35.56 
 
 
614 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  34.66 
 
 
329 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  30.06 
 
 
856 aa  87.8  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.63 
 
 
4687 aa  87.8  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  38.33 
 
 
1213 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  39.22 
 
 
2105 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  32.66 
 
 
1079 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  33.1 
 
 
1168 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  30.88 
 
 
858 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.81 
 
 
2678 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  35.14 
 
 
942 aa  84.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  33.04 
 
 
531 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  33.13 
 
 
341 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  35.88 
 
 
2911 aa  83.2  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  33.14 
 
 
526 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  32.59 
 
 
531 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  30.53 
 
 
1072 aa  82  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  34.12 
 
 
1883 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  32.7 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  26.59 
 
 
1055 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  31.5 
 
 
623 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  32.01 
 
 
1287 aa  80.1  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  30.65 
 
 
889 aa  79.7  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  33.9 
 
 
1164 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  34.02 
 
 
855 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.54 
 
 
1145 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.38 
 
 
2775 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.66 
 
 
1279 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  36.18 
 
 
933 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.74 
 
 
1795 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  31.52 
 
 
901 aa  77.8  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  33.23 
 
 
1480 aa  75.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  42.97 
 
 
1650 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  31.71 
 
 
556 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.52 
 
 
4798 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>