250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1286 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 482 aa  972    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  49.71 
 
 		 676 aa  477  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  49.8 
 
 		 875 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  51.85 
 
 		 400 aa  382  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  42.72 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  43.85 
 
 		 766 aa  285  9e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  41.51 
 
 		 469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  42.2 
 
 		 371 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  39.65 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.18 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  40.29 
 
 		 748 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.9 
 
 		 387 aa  226  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.86 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.6 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.86 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.46 
 
 		 455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.11 
 
 		 451 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.12 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.43 
 
 		 388 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.57 
 
 		 460 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.93 
 
 		 403 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  35.76 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  35.02 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  35.36 
 
 		 475 aa  174  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.26 
 
 		 388 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.96 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.16 
 
 		 570 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.5 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  33.01 
 
 		 2172 aa  150  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  35.35 
 
 		 518 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.04 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  30.87 
 
 		 712 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  32.77 
 
 		 841 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.75 
 
 		 585 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  31.9 
 
 		 561 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.55 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  35.09 
 
 		 1029 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  31.45 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  33.46 
 
 		 1657 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  30.31 
 
 		 999 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  35.32 
 
 		 381 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  30.31 
 
 		 999 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  29.62 
 
 		 999 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  28.73 
 
 		 367 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 908 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2449  hypothetical protein  25.6 
 
 		 476 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.396913  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  31.27 
 
 		 366 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  30.49 
 
 		 1444 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2435  hypothetical protein  26.26 
 
 		 476 aa  90.1  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0561908  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  26.46 
 
 		 469 aa  90.1  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2727  hypothetical protein  25.12 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  31.27 
 
 		 392 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  36.27 
 
 		 357 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  29.63 
 
 		 408 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  26.54 
 
 		 397 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  28.9 
 
 		 462 aa  87  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2774  hypothetical protein  25.18 
 
 		 476 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  27.69 
 
 		 399 aa  86.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.3 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  30.8 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  29.94 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  26.54 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  33.77 
 
 		 1138 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  31.72 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  27.38 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  30.68 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  29.7 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2738  hypothetical protein  25.66 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2484  hypothetical protein  24.94 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000160653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2722  hypothetical protein  24.7 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000210589 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2581  hypothetical protein  27.42 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2524  hypothetical protein  24.94 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.433899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2709  hypothetical protein  24.94 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.5 
 
 		 729 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.37 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  32.33 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  29.55 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  26.23 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  26.4 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  26.85 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  27.78 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 		 387 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  29.51 
 
 		 972 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  27.78 
 
 		 530 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  32.36 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  28.83 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  30.5 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  30.5 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  29.09 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  31.8 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  31.46 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  26.26 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 1505 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  28.62 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.25 
 
 		 945 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  26.84 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  29.67 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  26.6 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  28.06 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>