84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0137 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  100 
 
 		 1656 aa  3353    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  48.05 
 
 		 2170 aa  700    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1853 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1853 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  36.68 
 
 		 1574 aa  399  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  50.68 
 
 		 326 aa  312  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  49.66 
 
 		 321 aa  308  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1231  NHL repeat-containing protein  32.07 
 
 		 1049 aa  279  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.001634  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  37.74 
 
 		 1461 aa  194  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  61.48 
 
 		 1342 aa  156  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  32.09 
 
 		 312 aa  144  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  51.16 
 
 		 1216 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  30.25 
 
 		 344 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  31.58 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  31.25 
 
 		 317 aa  119  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  31.71 
 
 		 1762 aa  119  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  30.58 
 
 		 321 aa  111  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  27.59 
 
 		 341 aa  110  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  30.07 
 
 		 445 aa  105  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  43.65 
 
 		 823 aa  104  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  26.48 
 
 		 318 aa  102  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  30.25 
 
 		 776 aa  101  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  28.37 
 
 		 339 aa  97.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  27.55 
 
 		 373 aa  97.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  28.62 
 
 		 990 aa  95.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3897  hypothetical protein  42.98 
 
 		 859 aa  93.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  normal  0.272372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  27.55 
 
 		 717 aa  93.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  27.65 
 
 		 812 aa  91.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  29.83 
 
 		 795 aa  90.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  26.63 
 
 		 334 aa  89.4  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  24.89 
 
 		 1557 aa  88.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  26.72 
 
 		 1193 aa  83.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  24.72 
 
 		 586 aa  83.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  26.43 
 
 		 2706 aa  83.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  26.1 
 
 		 993 aa  78.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0557  hypothetical protein  36.97 
 
 		 295 aa  78.6  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  27.27 
 
 		 497 aa  75.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1919  hypothetical protein  40.17 
 
 		 872 aa  75.5  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  23.97 
 
 		 508 aa  75.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.49 
 
 		 693 aa  74.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 454 aa  75.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  25.71 
 
 		 314 aa  73.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  25.4 
 
 		 1017 aa  73.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  25.87 
 
 		 2942 aa  72.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  26.44 
 
 		 471 aa  71.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  25.08 
 
 		 1009 aa  70.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  25.08 
 
 		 1009 aa  70.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45737  predicted protein  32.68 
 
 		 882 aa  68.9  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194505  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  24.44 
 
 		 642 aa  64.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  25.22 
 
 		 430 aa  62  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  27.75 
 
 		 1407 aa  60.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  27.54 
 
 		 3802 aa  59.3  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  25.49 
 
 		 336 aa  55.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.82 
 
 		 1453 aa  53.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  26.7 
 
 		 460 aa  54.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  25.85 
 
 		 962 aa  53.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  22.92 
 
 		 639 aa  53.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  25.72 
 
 		 725 aa  52.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  23.21 
 
 		 366 aa  52.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  23.97 
 
 		 646 aa  52.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  25.45 
 
 		 346 aa  52.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  26.49 
 
 		 483 aa  52.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  27.46 
 
 		 180 aa  51.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  26.52 
 
 		 514 aa  50.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48710  predicted protein  30.4 
 
 		 969 aa  51.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.873734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  26.2 
 
 		 450 aa  51.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  25.91 
 
 		 368 aa  50.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  27.23 
 
 		 605 aa  49.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  27.6 
 
 		 494 aa  49.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  25.53 
 
 		 698 aa  49.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  40.45 
 
 		 2848 aa  49.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  26.64 
 
 		 339 aa  49.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  32.38 
 
 		 1626 aa  49.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  26.98 
 
 		 726 aa  47.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.76 
 
 		 1783 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  24.72 
 
 		 448 aa  46.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  31.96 
 
 		 981 aa  45.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  27.78 
 
 		 1736 aa  45.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.78 
 
 		 392 aa  45.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  21.47 
 
 		 335 aa  45.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  23.24 
 
 		 752 aa  45.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.78 
 
 		 392 aa  45.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  25.97 
 
 		 887 aa  45.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>