104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0506 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 430 aa  858    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  34.5 
 
 		 776 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  31.58 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1557 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  28.78 
 
 		 312 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  28.33 
 
 		 2942 aa  90.9  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  29.35 
 
 		 344 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 454 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  29.97 
 
 		 1017 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  29.15 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 1009 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  29.63 
 
 		 1009 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  30.89 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  25.45 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  27.51 
 
 		 341 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1762 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  29 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  29.81 
 
 		 993 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  30.89 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  30.49 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  40.57 
 
 		 741 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  29.77 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  28.76 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  31.3 
 
 		 642 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  25.97 
 
 		 990 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.17 
 
 		 1453 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  39.22 
 
 		 1270 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  38.24 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  25.22 
 
 		 1656 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  28.36 
 
 		 795 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  36.36 
 
 		 902 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  24.29 
 
 		 667 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  25.8 
 
 		 717 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  26.58 
 
 		 373 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1514 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  30.69 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  28.5 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  28.51 
 
 		 693 aa  63.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  23 
 
 		 639 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  26.38 
 
 		 812 aa  62.4  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  29.67 
 
 		 1407 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  43.48 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  25.1 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.18 
 
 		 1451 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  31.36 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  39.77 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  24.69 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  27.8 
 
 		 646 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  38 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  29.88 
 
 		 314 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  37.5 
 
 		 844 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  32.26 
 
 		 615 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  30 
 
 		 851 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.54 
 
 		 1092 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  34.85 
 
 		 931 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  41.38 
 
 		 468 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  28.14 
 
 		 586 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  24 
 
 		 595 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  25.91 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  36.56 
 
 		 525 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  37.27 
 
 		 479 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  31.13 
 
 		 152 aa  53.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  28.33 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  26.61 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  25.78 
 
 		 698 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  31.3 
 
 		 258 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  41.67 
 
 		 990 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  30.77 
 
 		 516 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  23.46 
 
 		 725 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  37.76 
 
 		 763 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  25.64 
 
 		 497 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  34.48 
 
 		 676 aa  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  44 
 
 		 218 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1744 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  39.02 
 
 		 908 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  39.13 
 
 		 562 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  38.78 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  35.58 
 
 		 494 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  35.35 
 
 		 287 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  34.69 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  23.56 
 
 		 588 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 		 1556 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  26.8 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  30.22 
 
 		 327 aa  46.6  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  30.21 
 
 		 679 aa  46.6  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  29.53 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  29.01 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  33.65 
 
 		 966 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  35.87 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  36.67 
 
 		 829 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  27.14 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1343 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1519  flagellar hook assembly protein FlgD  35.09 
 
 		 335 aa  45.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  26.9 
 
 		 557 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  33.33 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  24.44 
 
 		 605 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  22.52 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>