29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2797 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  100 
 
 
1343 aa  2731    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  34.72 
 
 
1086 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  30.9 
 
 
1685 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4542  hypothetical protein  30.39 
 
 
1113 aa  383  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3441  hypothetical protein  31.32 
 
 
1106 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.248128  normal  0.639428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4254  hypothetical protein  41.37 
 
 
912 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  29.4 
 
 
996 aa  255  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  20.31 
 
 
1296 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  25.25 
 
 
1134 aa  63.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  27.24 
 
 
865 aa  63.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  22.67 
 
 
1017 aa  58.9  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  20.04 
 
 
1110 aa  58.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  23.12 
 
 
1152 aa  57.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  33.58 
 
 
294 aa  56.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  40.79 
 
 
741 aa  57  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  24.88 
 
 
1278 aa  55.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2371  hypothetical protein  24.4 
 
 
1267 aa  55.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.217084  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  21.33 
 
 
1125 aa  55.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  23.92 
 
 
1279 aa  53.5  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  28.33 
 
 
676 aa  52  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  33.62 
 
 
468 aa  51.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  41.33 
 
 
226 aa  50.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  24.53 
 
 
1347 aa  48.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  30.67 
 
 
902 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  28.78 
 
 
1123 aa  48.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  20 
 
 
884 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  20.87 
 
 
882 aa  45.8  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  34.67 
 
 
668 aa  45.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  30.88 
 
 
430 aa  45.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>