17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4542 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3441  hypothetical protein  50.32 
 
 		 1106 aa  1114    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.248128  normal  0.639428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4542  hypothetical protein  100 
 
 		 1113 aa  2284    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1086 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  35.29 
 
 		 996 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1343 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4254  hypothetical protein  28.09 
 
 		 912 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1685 aa  235  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  24.89 
 
 		 865 aa  65.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  21.27 
 
 		 1125 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1152 aa  62  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  20.25 
 
 		 1110 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  21.36 
 
 		 882 aa  48.1  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1296 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1017 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1279 aa  45.8  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  20.88 
 
 		 884 aa  45.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1134 aa  44.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>