57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0721 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  100 
 
 		 741 aa  1472    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  47.22 
 
 		 668 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  48.48 
 
 		 152 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  41.32 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  47.78 
 
 		 468 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  48.45 
 
 		 479 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  46.39 
 
 		 578 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  42.64 
 
 		 287 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  47.73 
 
 		 676 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  40.57 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  40.21 
 
 		 902 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  41.41 
 
 		 695 aa  71.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  42.39 
 
 		 615 aa  71.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  38.61 
 
 		 851 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.76 
 
 		 1092 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  35.59 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  40.54 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  37.5 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  38 
 
 		 545 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  35.71 
 
 		 990 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  37.61 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  42.86 
 
 		 931 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  41 
 
 		 1162 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  32.61 
 
 		 1061 aa  61.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  37.78 
 
 		 829 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  41.38 
 
 		 997 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1685 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  35.79 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1270 aa  57.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  39.29 
 
 		 258 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  40.79 
 
 		 1343 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0706  hypothetical protein  33.33 
 
 		 553 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.31357  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3452  hypothetical protein  31.6 
 
 		 407 aa  54.7  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.149809  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  38.37 
 
 		 398 aa  54.7  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0235  hypothetical protein  24.46 
 
 		 486 aa  53.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0416653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  36.7 
 
 		 468 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  37.5 
 
 		 763 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 		 1302 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3016  hypothetical protein  28.12 
 
 		 500 aa  52.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  35.35 
 
 		 527 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  37.37 
 
 		 554 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.23 
 
 		 492 aa  52  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  33.98 
 
 		 489 aa  51.6  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3019  hypothetical protein  28.05 
 
 		 476 aa  51.2  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3012  lipoprotein  25.32 
 
 		 437 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.214836  normal  0.364321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2832  hypothetical protein  27.42 
 
 		 465 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  33.77 
 
 		 1296 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1519  flagellar hook assembly protein FlgD  42 
 
 		 335 aa  49.3  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1037  hypothetical protein  28.66 
 
 		 409 aa  48.9  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0570191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  34.52 
 
 		 748 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  32.26 
 
 		 896 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  40.24 
 
 		 1347 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  32.56 
 
 		 966 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.18 
 
 		 542 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0162  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1634 aa  45.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  35.24 
 
 		 562 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  36.59 
 
 		 595 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>