40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2023 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  100 
 
 		 1061 aa  2223    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  28.78 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  43.9 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  28.99 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  41.18 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  43.37 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1162 aa  65.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  40.48 
 
 		 520 aa  63.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  41.33 
 
 		 152 aa  62  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  38.37 
 
 		 578 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  33.73 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  37.33 
 
 		 990 aa  58.9  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  37.08 
 
 		 468 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  35.71 
 
 		 554 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  40 
 
 		 741 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  36.47 
 
 		 668 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  29.28 
 
 		 468 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  30.61 
 
 		 908 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1270 aa  55.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  33.33 
 
 		 513 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  34.62 
 
 		 763 aa  54.3  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  43.94 
 
 		 615 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  21.76 
 
 		 748 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  33.75 
 
 		 695 aa  53.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  52.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  38 
 
 		 562 aa  52  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  33.7 
 
 		 997 aa  51.6  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  41.33 
 
 		 896 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  37.8 
 
 		 931 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  31.11 
 
 		 676 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  27.61 
 
 		 797 aa  49.3  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  42.25 
 
 		 258 aa  49.3  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  31.58 
 
 		 685 aa  48.5  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.54 
 
 		 1092 aa  48.5  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  31.58 
 
 		 689 aa  48.5  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  34.52 
 
 		 829 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  31.58 
 
 		 525 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  32.1 
 
 		 545 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  32.31 
 
 		 844 aa  45.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  32.47 
 
 		 1302 aa  44.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>