120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1280 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  100 
 
 		 479 aa  948    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  32.53 
 
 		 819 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  36.39 
 
 		 411 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  35.76 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  38.17 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  35.18 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  26.77 
 
 		 862 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  51.82 
 
 		 554 aa  97.1  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  44.14 
 
 		 679 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  48.98 
 
 		 615 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  51.65 
 
 		 287 aa  93.6  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  26.65 
 
 		 652 aa  93.6  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  32.95 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  48.86 
 
 		 516 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  48.45 
 
 		 741 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  39 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  40.52 
 
 		 990 aa  77  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  42.5 
 
 		 144 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  39.05 
 
 		 695 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  35.51 
 
 		 144 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  40.83 
 
 		 134 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  46.15 
 
 		 141 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  40.83 
 
 		 144 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  34.78 
 
 		 144 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  43.75 
 
 		 545 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  40.17 
 
 		 144 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  40.17 
 
 		 144 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  40.83 
 
 		 144 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  40.83 
 
 		 144 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  40.83 
 
 		 144 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  40.83 
 
 		 144 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  40.83 
 
 		 144 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  40.17 
 
 		 144 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  40.52 
 
 		 144 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  42.24 
 
 		 140 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  38.76 
 
 		 144 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  39.22 
 
 		 668 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  42.57 
 
 		 763 aa  70.1  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  44.32 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  45.24 
 
 		 258 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  43.88 
 
 		 797 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  42.2 
 
 		 578 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  50 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  38.38 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  39.78 
 
 		 1162 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  40.91 
 
 		 1270 aa  67.4  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  36.89 
 
 		 132 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  35.66 
 
 		 132 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  35.66 
 
 		 132 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  35.66 
 
 		 132 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  35.66 
 
 		 132 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  45.83 
 
 		 562 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  41.18 
 
 		 1061 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  37.07 
 
 		 144 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  34.88 
 
 		 132 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  29.18 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  35.34 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  35.34 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  40.43 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  39.13 
 
 		 997 aa  63.9  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  45.45 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  39.08 
 
 		 748 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  29.55 
 
 		 154 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  41.25 
 
 		 844 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.37 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  35.09 
 
 		 139 aa  61.6  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  38.81 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  40.19 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  41.86 
 
 		 931 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  39.78 
 
 		 908 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  37.93 
 
 		 595 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  40.91 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  38.82 
 
 		 966 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  43.59 
 
 		 1302 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  34.88 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  34.71 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.79 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  34.11 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  33.88 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  31.25 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  33.33 
 
 		 851 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  34.11 
 
 		 144 aa  56.6  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  31.82 
 
 		 513 aa  54.7  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  37.5 
 
 		 689 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  40.59 
 
 		 173 aa  53.9  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  37.5 
 
 		 685 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  37.27 
 
 		 430 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  34.88 
 
 		 525 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  36.21 
 
 		 149 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  38.46 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  29.76 
 
 		 524 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  37.04 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  32.98 
 
 		 902 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  36.15 
 
 		 151 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  37.62 
 
 		 151 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1194  hypothetical protein  38.03 
 
 		 531 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  37 
 
 		 152 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  38.71 
 
 		 156 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0939  CHRD domain-containing protein  37.84 
 
 		 167 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>