72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0634 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  100 
 
 
144 aa  294  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  96.53 
 
 
144 aa  285  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  81.94 
 
 
144 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  201  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  201  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  66.67 
 
 
144 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  67.36 
 
 
144 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  68.66 
 
 
134 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  64.58 
 
 
144 aa  190  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  66.67 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  62.5 
 
 
144 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  66.94 
 
 
144 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  55.64 
 
 
141 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  53.24 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  47.59 
 
 
147 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  47.54 
 
 
171 aa  123  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  49.18 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  49.66 
 
 
151 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  49.3 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  48.36 
 
 
144 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  49.56 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  50 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  52.46 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  47.24 
 
 
148 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  46.94 
 
 
173 aa  95.9  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  47.87 
 
 
140 aa  87  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  44.04 
 
 
862 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  42.27 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  35.51 
 
 
479 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  35.59 
 
 
282 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  39.32 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  39.13 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  40.24 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  37.5 
 
 
408 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  30.08 
 
 
161 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  27.05 
 
 
819 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  27.94 
 
 
137 aa  53.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  33.03 
 
 
513 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  37.41 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1716  CHRD  33.56 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.344065  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  28.36 
 
 
407 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  31.16 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  35.9 
 
 
413 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  29.3 
 
 
460 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  35.04 
 
 
412 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0849  hypothetical protein  27.52 
 
 
213 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  33.04 
 
 
411 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  31.3 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  27.94 
 
 
652 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4998  CHRD domain-containing protein  26.36 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  30.53 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  30.22 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  30.53 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  30.53 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  30.53 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  28.68 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5438  hypothetical protein  24.81 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5294  hypothetical protein  24.81 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000867603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5053  hypothetical protein  24.81 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4883  hypothetical protein  24.81 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1290  CHRD  28.93 
 
 
206 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.200605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2578  hypothetical protein  25.69 
 
 
201 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  28.66 
 
 
460 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3749  CHRD domain-containing protein  26.77 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3954  CHRD domain containing protein  31.07 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  0.0638434 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4898  hypothetical protein  24.81 
 
 
137 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>