54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1174 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  100 
 
 		 140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  43.44 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  42.96 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  42.55 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  42.55 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  42.55 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  43.28 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  44.86 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  42.96 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  41.13 
 
 		 144 aa  93.6  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  42.11 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  42.11 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  42.11 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  42.11 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  42.11 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  42.11 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  38.46 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  43.85 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  40.88 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  41.04 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  47.87 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  47.87 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  47.37 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  47.37 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  47.37 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  40.29 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  42.96 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  40.29 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  35 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  40.71 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  41.67 
 
 		 199 aa  72  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2480  CHRD domain-containing protein  34.65 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0119714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  39.25 
 
 		 862 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  40.19 
 
 		 479 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0581  CHRD domain-containing protein  38.98 
 
 		 408 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  28.7 
 
 		 282 aa  50.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  29.7 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5666  CHRD domain containing protein  25.32 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  35.8 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  36.14 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  47.06 
 
 		 411 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2026  CHRD domain containing protein  31.13 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  38.81 
 
 		 513 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  34.94 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  34.94 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  34.94 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  34.94 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  34.94 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  30.84 
 
 		 407 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  47.06 
 
 		 413 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2054  CHRD domain-containing protein  36.23 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.332284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3336  CHRD domain containing protein  46.27 
 
 		 412 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  32.04 
 
 		 819 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>